Secția investiții energie termică şi cogenerare examinează și monitorizează aplicarea de către titularii de licențe reglementați a prevederilor regulamentelor și metodologiilor ce țin de planificarea, aprobarea și realizarea investițiilor, efectuează și analizează calculele pierderilor normative de energie termică, examinează și propune spre coordonare programul de producere al întreprinderilor din sectorul termoenergetic, examinează adresările titularilor de licențe, autorităților publice centrale și locale, petiţiile consumatorilor privind activitatea titularilor de licențe în corespundere cu cadrul legal.